২০২০ সালের ১৯ মার্চ ভোররাত ৩টা ৩০ মিনিটে রাজধানীর স্কয়ার হাসপাতালে তিনি শেষ নিশ্বাস ত্যাগ করেন। মৃত্যুকালে তাঁর বয়স হয়েছিল ৮০ বছর। তিনি স্ত্রী, তিন ছেলে, নাতি-নাতনিসহ অসংখ্য গুণগ্রাহী রেখে গেছেন। মরহুমের ওসিয়তের মর্মানুযায়ী তাঁকে বনানী কবরস্থানে দাফন করা হয়েছিল।

কাজী আব্দুল মান্নানের তৃতীয় মৃত্যুবার্ষিকীতে তাঁর নিজ বাড়ি সাতক্ষীরা ও ঢাকায় দিনভর পবিত্র কোরান তেলোয়াত, জিয়ারত, দোয়া ও তাবারক বিতরণের আয়োজন করা হয়েছে।

ড. কাজী এরতেজা হাসান সিআইপি তাঁর জীবনে পিতার অবদানের কথা স্মরণ করে বলেন, ‘আব্বাকে হারানোর তিন বছর চলে গেল। এখনো প্রতি ক্ষণেই তাঁর অভাব অনুভব করি। আপনারা সবাই আমার মরহুম আব্বার জন্য দোয়া করবেন, তিনি যেনো জান্নাতুল ফেরদৌসের চিরস্থায়ী অধিবাসী হতে পারেন।